Idiopathische epilepsie komt regelmatig voor bij Border Collies. Het is bekend dat Border Collies met epilepsie vaak onvoldoende reageren op gangbare epilepsie medicatie, met name op fenobarbital. De verminderde reactie op fenobarbital wordt ook wel fenobarbital resistentie genoemd. Behalve fenobarbital resistentie zijn veel Border Collies ook aangedaan door MDR1, wat hen gevoeliger maakt voor bijwerkingen van veel soorten medicatie.

Fenobarbital resistentie wordt (net als MDR1) veroorzaakt door een defect in de bloed hersenbarrière. In het geval van fenobarbital resistentie werkt de bloed hersenbarriere als het ware te sterk, waardoor er niet genoeg fenobarbital van het bloed naar de hersenen wordt getransporteerd. Als gevolg hiervan komt er niet voldoende fenobarbital bij het doelorgaan, de hersenen, om het gewenste effect van de medicatie te kunnen veroorzaken.

Fenobarbital resistentie in Border Collies is niet te behandleen, maar gelukkig kan het wel getest worden met een DNA-test: MDR1 Multi Drug Resistance – Fenobarbital resistentie, met testnummer H754.